Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc3h12aQ5D1E7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms