Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Urb1Q571H0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Urb1Q571H0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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