Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms