Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt35Q497I4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt35Q497I4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms