Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Fam220aQ3ZN08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Fam220aQ3ZN08 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Fam220aQ3ZN08 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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