Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim26Q3V460 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms