Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms