Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr7Q3V0I2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms