Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms