Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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