Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbm44Q3V089 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rbm44Q3V089 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm44Q3V089 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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