Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms