Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5aQ3UXZ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms