Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D130052B06RikQ3UW13 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms