Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms