Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms