Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm5460Q3UQ97 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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