Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elf3Q3UPW2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elf3Q3UPW2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms