Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp953Q3UPV7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp953Q3UPV7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms