Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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