Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef40Q3UPH7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms