Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem253Q3UNB8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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