Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms