Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd27Q3UMR0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms