Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cog7Q3UM29 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cog7Q3UM29 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms