Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms