Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b2Q3UJB0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms