Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mier3Q3UHF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms