Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U595 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Q3U595 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Q3U595 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U595 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U595 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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