Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VwceQ3U515 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VwceQ3U515 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VwceQ3U515 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VwceQ3U515 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms