Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gse1Q3U3C9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms