Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms