Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LcorlQ3U285 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms