Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hace1Q3U0D9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms