Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl4Q3TZA2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl4Q3TZA2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms