Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms