Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc136Q3TVA9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms