Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms