Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc10Q3TLI0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms