Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms