Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde12Q3TIU4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms