Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam107bQ3TGF2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam107bQ3TGF2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms