Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl1Q3TC46 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl1Q3TC46 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms