Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms