Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap5b1Q3TAP4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms