Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccbe1Q3MI99 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccbe1Q3MI99 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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