Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vax1Q2NKI2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vax1Q2NKI2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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