Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1123Q1RME4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms