Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne9Q1RLL3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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