Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ptchd1Q14B62 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ptchd1Q14B62 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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